海洋の生物種や生態、その機能などの海に関する新発見や、海洋での発見を支援する新しいデータや技術に関する研究開発を大規模に支援することで、それらの研究を強力に推進・イノベーション創出を促進する。その成果を、海洋政策研究所による海洋の可視化・健全性評価の加速、海洋政策の採るべき方向性の提示に活用する。

2024年度は、昨年度の第１回公募にて採択した４課題に対する助成を行うとともに、助成制度の運営（それらの代表機関へのサイトビジットや研究代表者からの中間報告(進捗報告)に基づき、第２事業期間(2025年度)に向けた評価の実施など）を行う。